Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms