Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf48Q3US17 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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