Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rtl4Q3URY0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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