Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5460Q3UQ97 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5460Q3UQ97 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5460Q3UQ97 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm5460Q3UQ97 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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