Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms