Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms