Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp30Q3UN04 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms