Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms