Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc106Q3ULM0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms