Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms