Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms