Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm21748Q3UE70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21748Q3UE70 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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