Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp8Q3UD82 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms