Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms