Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q3U7U4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms