Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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