Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hectd3Q3U487 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hectd3Q3U487 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms