Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms