Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otud5Q3U2S4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms