Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms