Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms