Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnjQ3TZI6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms