Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms