Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms