Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms