Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb38Q3LR78 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb38Q3LR78 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms