Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms