Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shroom4Q1W617 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms