Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms