Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne9Q1RLL3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms