Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmprss11cQ1JRP2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms