Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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Fam171bQ14CH0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms