Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd3Q14AI6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd3Q14AI6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd3Q14AI6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd3Q14AI6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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