Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd2Q149F1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms