Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spatc1Q148B6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms