Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtel1Q0VGM9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms