Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms