Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc45a4Q0P5V9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc45a4Q0P5V9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc45a4Q0P5V9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc45a4Q0P5V9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc45a4Q0P5V9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc45a4Q0P5V9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms