Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms