Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc21bQ0HA38 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms