Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms