Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc7a1Q09143 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms