Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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