Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnma1Q08460 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnma1Q08460 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms