Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms