Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms