Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms