Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms