Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fmn1Q05860 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fmn1Q05860 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms