Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col10a1Q05306 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col10a1Q05306 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms